El escudo es obra del artista y experto en heráldica Fray Bernardo Molina: coronado por la tiara papal, al centro aparece el sol, que recuerda el sublime cántico de las criaturas de San Francisco de Asís. Abajo, cerrando el triángulo, la torre Mudéjar que se destaca airosa en los Farallones de Cali, uno de los símbolos más representativos en el escudo de la ciudad
Sello de identidad
El Sello de identidad tiene el nombre del Colegio en color azul, una marca que indica su vinculación con la Familia Franciscana y por consecuencia con la Iglesia y el año de fundación de la institución. En el centro, en formato de marca de agua, está el escudo institucional
Bandera
La bandera del Colegio consta de tres franjas horizontales: amarillo, blanco y azul, de igual anchura, y combina las banderas mariana y pontificia, recordando que bajo el patronato de María Inmaculada y con el nombre de Pío XII se erigió el plantel